Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF6

FBXO17, F-box only protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO17Q96EF6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FBXO17Q96EF6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms