Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIRT1Q96EB6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms