Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA4

GTF3C2, General transcription factor 3C polypeptide 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2Q8WUA4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF3C2Q8WUA4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C2Q8WUA4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms