Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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