Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF548Q8NEK5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
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