Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARRDC4Q8NCT1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms