Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNBD1Q8NA66 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNBD1Q8NA66 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms