Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms