Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT2Q8N9I0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYT2Q8N9I0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYT2Q8N9I0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYT2Q8N9I0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYT2Q8N9I0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYT2Q8N9I0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYT2Q8N9I0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SYT2Q8N9I0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT2Q8N9I0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT2Q8N9I0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT2Q8N9I0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT2Q8N9I0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT2Q8N9I0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT2Q8N9I0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT2Q8N9I0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT2Q8N9I0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT2Q8N9I0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT2Q8N9I0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT2Q8N9I0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT2Q8N9I0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT2Q8N9I0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT2Q8N9I0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT2Q8N9I0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT2Q8N9I0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT2Q8N9I0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT2Q8N9I0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT2Q8N9I0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT2Q8N9I0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT2Q8N9I0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT2Q8N9I0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT2Q8N9I0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT2Q8N9I0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT2Q8N9I0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT2Q8N9I0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT2Q8N9I0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms