Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS37DQ86XT2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS37DQ86XT2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS37DQ86XT2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS37DQ86XT2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS37DQ86XT2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS37DQ86XT2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS37DQ86XT2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS37DQ86XT2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS37DQ86XT2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS37DQ86XT2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS37DQ86XT2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS37DQ86XT2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS37DQ86XT2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms