Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC84Q86UT8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms