Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC29A4Q7RTT9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms