Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms