Protein–RNA interactions for Protein: Q7L576

CYFIP1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1Q7L576 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYFIP1Q7L576 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYFIP1Q7L576 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYFIP1Q7L576 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYFIP1Q7L576 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYFIP1Q7L576 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP1Q7L576 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP1Q7L576 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP1Q7L576 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP1Q7L576 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP1Q7L576 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP1Q7L576 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP1Q7L576 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP1Q7L576 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP1Q7L576 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP1Q7L576 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP1Q7L576 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP1Q7L576 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP1Q7L576 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP1Q7L576 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP1Q7L576 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP1Q7L576 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP1Q7L576 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP1Q7L576 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP1Q7L576 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP1Q7L576 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP1Q7L576 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYFIP1Q7L576 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms