Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
HECW1Q76N89 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC31■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms