Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms