Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM43BQ6ZT52 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms