Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms