Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWI4

SHISA2, Protein shisa-2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA2Q6UWI4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms