Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms