Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms