Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUQ1

RINT1, RAD50-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RINT1Q6NUQ1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RINT1Q6NUQ1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RINT1Q6NUQ1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RINT1Q6NUQ1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RINT1Q6NUQ1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RINT1Q6NUQ1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RINT1Q6NUQ1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RINT1Q6NUQ1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RINT1Q6NUQ1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RINT1Q6NUQ1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RINT1Q6NUQ1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RINT1Q6NUQ1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RINT1Q6NUQ1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RINT1Q6NUQ1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RINT1Q6NUQ1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RINT1Q6NUQ1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RINT1Q6NUQ1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RINT1Q6NUQ1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RINT1Q6NUQ1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RINT1Q6NUQ1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RINT1Q6NUQ1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RINT1Q6NUQ1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RINT1Q6NUQ1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RINT1Q6NUQ1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RINT1Q6NUQ1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RINT1Q6NUQ1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RINT1Q6NUQ1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RINT1Q6NUQ1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RINT1Q6NUQ1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RINT1Q6NUQ1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RINT1Q6NUQ1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RINT1Q6NUQ1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RINT1Q6NUQ1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RINT1Q6NUQ1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RINT1Q6NUQ1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RINT1Q6NUQ1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RINT1Q6NUQ1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms