Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CREB3L3Q68CJ9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms