Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM78BQ5VT40 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms