Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms