Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms