Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms