Protein–RNA interactions for Protein: Q504Q3

PAN2, PAN2-PAN3 deadenylation complex catalytic subunit PAN2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN2Q504Q3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAN2Q504Q3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAN2Q504Q3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms