Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXF1

FAM74A3, Putative protein FAM74A3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A3Q4VXF1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM74A3Q4VXF1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms