Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms