Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms