Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UVSSAQ2YD98 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms