Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms