Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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