Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RTN1Q16799 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
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