Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMA3Q16787 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA3Q16787 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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