Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USF2Q15853 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USF2Q15853 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USF2Q15853 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USF2Q15853 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USF2Q15853 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USF2Q15853 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USF2Q15853 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
USF2Q15853 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USF2Q15853 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USF2Q15853 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USF2Q15853 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USF2Q15853 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USF2Q15853 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USF2Q15853 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USF2Q15853 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USF2Q15853 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USF2Q15853 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USF2Q15853 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USF2Q15853 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USF2Q15853 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USF2Q15853 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USF2Q15853 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USF2Q15853 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USF2Q15853 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USF2Q15853 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USF2Q15853 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USF2Q15853 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USF2Q15853 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USF2Q15853 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USF2Q15853 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USF2Q15853 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USF2Q15853 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USF2Q15853 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USF2Q15853 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USF2Q15853 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USF2Q15853 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USF2Q15853 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USF2Q15853 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF2Q15853 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF2Q15853 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF2Q15853 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF2Q15853 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF2Q15853 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF2Q15853 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF2Q15853 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USF2Q15853 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF2Q15853 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF2Q15853 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF2Q15853 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF2Q15853 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USF2Q15853 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF2Q15853 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF2Q15853 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USF2Q15853 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF2Q15853 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USF2Q15853 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF2Q15853 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF2Q15853 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF2Q15853 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF2Q15853 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF2Q15853 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF2Q15853 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF2Q15853 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF2Q15853 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF2Q15853 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF2Q15853 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF2Q15853 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF2Q15853 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF2Q15853 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF2Q15853 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF2Q15853 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF2Q15853 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF2Q15853 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF2Q15853 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF2Q15853 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF2Q15853 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF2Q15853 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF2Q15853 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF2Q15853 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USF2Q15853 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF2Q15853 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF2Q15853 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF2Q15853 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF2Q15853 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF2Q15853 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF2Q15853 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF2Q15853 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF2Q15853 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF2Q15853 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF2Q15853 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF2Q15853 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USF2Q15853 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF2Q15853 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF2Q15853 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF2Q15853 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF2Q15853 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF2Q15853 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF2Q15853 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF2Q15853 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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