Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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