Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms