Protein–RNA interactions for Protein: Q15024

EXOSC7, Exosome complex component RRP42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC7Q15024 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EXOSC7Q15024 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms