Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD4Q14CM0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD4Q14CM0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD4Q14CM0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD4Q14CM0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD4Q14CM0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD4Q14CM0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD4Q14CM0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD4Q14CM0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD4Q14CM0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD4Q14CM0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD4Q14CM0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD4Q14CM0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD4Q14CM0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD4Q14CM0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD4Q14CM0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD4Q14CM0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD4Q14CM0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD4Q14CM0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD4Q14CM0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD4Q14CM0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD4Q14CM0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD4Q14CM0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD4Q14CM0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD4Q14CM0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD4Q14CM0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms