Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SHPRHQ149N8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
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SHPRHQ149N8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
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