Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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COL19A1Q14993 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL19A1Q14993 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL19A1Q14993 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL19A1Q14993 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL19A1Q14993 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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COL19A1Q14993 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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COL19A1Q14993 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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COL19A1Q14993 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL19A1Q14993 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL19A1Q14993 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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COL19A1Q14993 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL19A1Q14993 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL19A1Q14993 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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COL19A1Q14993 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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COL19A1Q14993 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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COL19A1Q14993 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
COL19A1Q14993 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL19A1Q14993 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL19A1Q14993 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL19A1Q14993 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL19A1Q14993 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL19A1Q14993 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL19A1Q14993 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL19A1Q14993 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL19A1Q14993 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL19A1Q14993 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL19A1Q14993 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
COL19A1Q14993 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL19A1Q14993 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL19A1Q14993 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL19A1Q14993 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL19A1Q14993 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL19A1Q14993 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL19A1Q14993 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
COL19A1Q14993 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL19A1Q14993 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL19A1Q14993 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL19A1Q14993 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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