Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFIXQ14938 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFIXQ14938 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFIXQ14938 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFIXQ14938 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFIXQ14938 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFIXQ14938 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFIXQ14938 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFIXQ14938 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFIXQ14938 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFIXQ14938 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFIXQ14938 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFIXQ14938 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFIXQ14938 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NFIXQ14938 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFIXQ14938 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFIXQ14938 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFIXQ14938 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFIXQ14938 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFIXQ14938 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFIXQ14938 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NFIXQ14938 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFIXQ14938 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFIXQ14938 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFIXQ14938 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NFIXQ14938 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFIXQ14938 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFIXQ14938 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms