Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBFBQ13951 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms