Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms