Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NAE1Q13564 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NAE1Q13564 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NAE1Q13564 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NAE1Q13564 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NAE1Q13564 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NAE1Q13564 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NAE1Q13564 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NAE1Q13564 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NAE1Q13564 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NAE1Q13564 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NAE1Q13564 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NAE1Q13564 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NAE1Q13564 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NAE1Q13564 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NAE1Q13564 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NAE1Q13564 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NAE1Q13564 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NAE1Q13564 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NAE1Q13564 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NAE1Q13564 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NAE1Q13564 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NAE1Q13564 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NAE1Q13564 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms