Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED1Q13445 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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