Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRSQ13332 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRSQ13332 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRSQ13332 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PTPRSQ13332 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRSQ13332 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRSQ13332 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRSQ13332 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRSQ13332 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRSQ13332 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRSQ13332 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRSQ13332 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRSQ13332 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRSQ13332 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRSQ13332 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRSQ13332 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRSQ13332 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRSQ13332 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRSQ13332 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRSQ13332 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRSQ13332 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRSQ13332 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRSQ13332 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRSQ13332 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRSQ13332 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRSQ13332 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRSQ13332 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPRSQ13332 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRSQ13332 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRSQ13332 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRSQ13332 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPRSQ13332 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRSQ13332 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRSQ13332 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRSQ13332 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRSQ13332 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRSQ13332 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRSQ13332 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRSQ13332 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRSQ13332 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRSQ13332 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRSQ13332 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPRSQ13332 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRSQ13332 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRSQ13332 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRSQ13332 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRSQ13332 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPRSQ13332 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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PTPRSQ13332 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRSQ13332 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRSQ13332 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRSQ13332 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRSQ13332 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRSQ13332 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRSQ13332 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPRSQ13332 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPRSQ13332 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRSQ13332 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPRSQ13332 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRSQ13332 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPRSQ13332 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRSQ13332 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRSQ13332 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRSQ13332 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRSQ13332 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRSQ13332 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRSQ13332 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRSQ13332 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRSQ13332 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRSQ13332 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRSQ13332 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRSQ13332 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRSQ13332 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRSQ13332 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRSQ13332 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRSQ13332 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRSQ13332 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRSQ13332 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRSQ13332 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRSQ13332 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRSQ13332 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRSQ13332 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRSQ13332 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRSQ13332 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRSQ13332 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRSQ13332 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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