Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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